Motools VS JQuerry - две библиотеки для моих любимых javascripts. Говорят, что JQuerry - для начинающих, Motools - для продвинутых.

Если подключать обе библиотеки одновременно (а Joomla подключает Motools по умолчанию) - то нифига не работает. Это потому что  к функциям в обеих библиотеках нужно обращаться с помощью символа $  - браузер начинает путаться.

Можно помочь браузеру переназначив способ вывода функций (в head):

   <script>
     jQuery.noConflict();
     
     // Вызов через jQuery(...)
     jQuery(document).ready(function(){
       jQuery("div").hide();
     });
     
     // Для Mootools оставляем $(...)
     $('someid').hide();
   </script>

Найдено в HTMLBlog - почитайте там комментарии, если всё-же не все браузеры работают как вам хочется.